Команда под руководством Вильяма Митчелла из университета Вандербилта представила новый метод определения внеклеточных опухолевых ДНК в крови пациентов. Открытие улучшит диагностику рака и позволит с легкостью отслеживать результаты назначенного лечения.
Новый метод «жидкой биопсии» способен отличить рак без предварительных знаний о генетических особенностях опухолей. Крупное исследование подтвердило, что метод работает в три раза эффективнее анализа на простатический специфический антиген (ПСА), который сейчас считается золотым стандартом диагностики.
В исследовании участвовало 200 мужчин с раком простаты и более 200 мужчин без опухолей. Ученые предварительно определили уровни ПСА участников и собрали образцы тканей простаты. Новая методика с 84-процентной точностью отличила раковые клетки от нормальных, и с 91-процентной точностью определила рак по сравнению с гиперплазией простаты и простатитом.
Метод основан на количественном выявлении хромосомной нестабильности рака путем изменений, которые происходит в определенный отрезок времени, потому исключает необходимость взятия образца тканей. Ежегодно умирающие клетки, в том числе клетки опухолей, оставляют ДНК-следы в крови человека. Но только особая технология секвенирования смогла количественно оценить отличие генома раковых от здоровых клеток, изучая миллионы образцов внеклеточных ДНК, представленных в кровотоке.
Ученым удалось выявить 20 отличительных признаков хромосомной нестабильности, которые заключались в дублировании или отсутствии сегментов ДНК, и они составили всего 0,5% от всего генома, представленного хромосомами.
Группа Митчелла смогла добиться результата за счет анализа всего генома. Именно это позволило усовершенствовать мониторинг, поскольку раковые клетки постоянно отдают части ДНК кровотоку. Традиционное использование ограниченных образцов мутаций сужает поиск и позволяет раковым клеткам оставаться незамеченными.
Изучая геном целиком, ученые выявили те некодируемые области, которые становятся источниками хромосомных признаков для диагностики рака простаты. Остальные 19 признаков касались генов, которые участвуют в процессе контроля репликации клеток и имеют непосредственное отношение к раку.
Внеклеточные ДНК недолго остаются в крови, потому новая методика секвенирования поможет определить следы остатка крупных опухолей сразу же после окончания курса химиотерапии. Основное преимущество жидкой биопсии — количественное измерение реакции рака на лечение, что позволит повысить эффективность терапии.