Во время заболеваний каждая клетка организма испытывает стресс. Ученые из женской больницы Бригэма задались вопросом о том, что происходит с бактериями в кишечнике во время инфекционных болезней?
«В кишечнике содержится в десять раз больше бактериальных клеток, чем человеческих клеток во всем организме», — говорит Линн Бри, глава центра клинической и трансляционной метагеномики. — «Поведение этих сложных бактериальных экосистем в период инфекции может оказывать большое влияние на здоровье».
Георг Гербер, первый соавтор исследования, разработал принципиально новые компьютерные алгоритмы для анализа различных стадий инфекции. Для проведения опытов ученые вводили возбудитель Citrobacter rodentium в организм мышей и вызывали симптомы пищевого отравления. На протяжении двух месяцев они отслеживали количественный состав бактерий в нескольких точках кишечника. Используя новейшую разработку, ученые изучали динамические изменения внутри комплексов бактериальных сообществ на фоне инфекции и воспаления.
Ученым удалось зафиксировать нарушение структуры нормальной микрофлоры. Например, количество микробов рода Mucispirillum заметно уменьшается в начале заражения до появления симптомов, одновременно увеличиваются популяции бактерий Clostridiales и Lactobacillales. Интересным оказалось то, что изменения происходили в зонах кишечника, в которых инфекция не оказывала прямого влияния на клетки.
Новые знания помогут врачам выявлять воспаление на ранних стадиях или контролировать течение хронических воспалительных заболеваний кишечника. Также информация понадобится для исследования других инфекционных и воспалительных заболеваний.